Fue juzgado por el Juez Cuarto de Distrito con sede en la ciudad de Querétaro,  Rodolfo Pedraza Longi, el mismo que sentenció a las mujeres ñhañhö Jacinta Francisco Marcial, Teresa González y Alberta Alcántara Juan, a 21 años de prisión por haber secuestrado a seis agentes de la Agencia Federal de Investigaciones (AFI).

Las tres mujeres lograron su libertad al existir duda razonable por cuanto a la culpabilidad que les achacaron; es decir, que sus acusadores no lograron probar su dicho.

Juan Ranulfo, quien antes de ser detenido se desempeñaba como inspector de alcoholes en el gobierno municipal de El Marqués y era director y violinista del grupo "Danza Chichimeca de La Cañada", siguió el mismo camino que recorrieron las 3 mujeres de Amealco.

"Supuestamente yo traficaba con gente, pero lo que pasó es que detuvieron a 3 indocumentados dentro de mi terreno. Los agentes les dijeron que firmaran un documento y que con eso los dejaban ir, pero en realidad en los papeles que les dieron decía que yo traficaba con gente", narró Juan Ranulfo.

Juan Ranulfo Martínez sostuvo que su único delito fue dar agua a los emigrantes.

"Es que como mi terreno no tiene barda y tiene una llave de agua. Ahí bajaban (los emigrantes)... como es cambio de vía, bajaban por agua y como yo nunca se las negué, pues agarraban su agua y se iban. Y no nada más yo; todo el barrio les daba un taco, agua... nunca les negábamos nada".

Martínez Pérez, acaba de cumplir 51 años de edad y asegura que los casi tres años y medio que estuvo en la cárcel "prácticamente estuve muerto porque mi familia y todos sufrieron. Se perdió la convivencia con ellos. Además perdí mi trabajo y era un salario más o menos".

Cuando fue detenido, su caso fue tomado por el abogado Reginaldo Rivera de la Torre, quien hoy se desempeña como diputado federal por el Partido Revolucionario Institucional (PRI).

El legislador dejó el caso, sin avisar a la familia ni a Juan Ranulfo. Se volvió a saber de este caso hasta que el pasado 19 de octubre del 2010, la junta de coordinación política de la 61 legislatura federal, aprobó un punto de acuerdo mediante el cual se exhorta a la Procuraduría General de la República, a la Comisión Nacional de los Derechos Humanos y al Poder Judicial de la Federación, "a revisar en estricto apego a derecho, el caso del C. Juan Ranulfo Martínez Pérez".

Ahora, ya en libertad, una de sus principales preocupación es la forma en que podrá sostener a su familia, compuesta por su esposa y seis hijos.